​Actualmente el Instituto Tecnológico de Sonora cuenta con nueve programas de posgrado clasificados dentro del Padrón Nacional de Posgrados de Calidad (PNPC). Estos programas son:

Maestro en Ciencias en Recursos Naturales, Maestro en Ciencias de la Ingeniería, Maestro en Investigación Psicológica, Maestro en Gestión Organizacional, Maestro en Investigación Educativa, Maestro en Tecnologías de la Información para los Negocios, Doctor en Ciencias de la Ingeniería, Doctor en Sistemas y Ambientes Educativos y Doctor en Ciencias Especialidad en Biotecnología.

El Consejo Nacional de Ciencia y Tecnología (CONACyT) apoya con una beca mensual durante todo el posgrado a aquellos alumnos que fueron aceptados en uno de estos programas dentro de la institución.

Para obtener más información sobre las becas de posgrado que otorga el CONACyT ingresa a: http://www.co​nacyt.mx/index.php/becas-y-posgrados/becas-nacionales ​​​​​​