​La autonomía concede a las casas de estudio el derecho de autogobernarse y tomar decisiones libremente sobre el desarrollo institucional y sobre los modos de vinculación con el marco social que rodea a la universidad.

Un 2 de octubre de 1976, se publica en el Boletín Oficial del Gobierno del Estado de Sonora la nueva Ley Orgánica del ITSON en la que se menciona:

"El Instituto Tecnológico de Sonora es un organismo público descentralizado, de carácter universitario, con personalidad jurídica y patrimonio propios; autónomo en cuanto a que, en el ejercicio de sus funciones de enseñanza, investigación y difusión, el Instituto dictará sus propios ordenamientos, organizará su funcionamiento y aplicará sus recursos económicos en la forma que estime conveniente".​